В ответ на: ...НДФЛ, который ИЗ фонда заработной платы.

НДФЛ начисляется на начисленную заработную плату.

В ответ на: Т.е. НДФЛ платит работник, а в ФСС платит работодатель.

Если учесть, что заработную плату платит работодатель, то получается, что и НДФЛ и ФСС - платит работодатель.

В ответ на: Т.е. нагрузка на работника увеличивается, нагрузка на работодателя снижается.

Не надо передёргивать карту, если деньги перечисляемые в ФСС начислить работнику, а потом, аналогично НДФЛ вычесть в ФСС - ничего не изменится.