как аквариумист со стажем напишу. воду в аквариумах дезинфицируют очень редко, только при случае болезни или "цветения" воды (вспышка одноклеточных зеленых водорослей). используют ультрафиолет и соответствующую химию.
мертвая вода, без микроорганизмов, плохо подходит для обитания в ней животных. нормальные аквариумные фильтры, помимо механической очистки, должны иметь биологическую фильтрацию. ее суть: на пористом материале фильтра заводится колония аэробных нитрифицирующих бактерий. они заведутся и сами, но есть и готовые заводские культуры. их назначение окислять аммиак и нитриты (ядовитые для рыб, и безопасные для человека в тех же концентрациях) из выделений водных животных до нитратов (относительно безвредные для рыб и вредные для человека). нитраты выводятся или подменами, или живыми растениями.
в замкнутых системах, где с подменами туго, например в промышленном рыбоводстве, прибегают к помощи анаэробных денитрифицирующих бактерий, которые восстанавливают аммоний, нитраты до газообразных азота и оксида азота.
для поддержания данного азотного цикла надо, чтобы кто-то гадил в воду постоянно, что в бассейне вряд ли возможно.
а очистку от микроорганизмов в аквариумах не производят.

беглое гугление говорит, что в бассейнах используется механическая фильтрация: скиммер и песок + почти всегда химия, если стоит задача именно дезинфекции. иногда УФ или озонирование.