В ответ на: А если я систему буду восстанавливать с помощью диска(который шел в комплекте с ноутом), то система восстановится именно к заводским настройкам?

Да. Поэтому копируем на внешний HDD всю информацию, типа "Мои документы", "рабочий стол" и прочую почту с закладками, после чего восстанавливаем в завод, копируем обратно, ставим заново нужные программки.