Я обычно так делаю.
Загружаю с флешки дистрибутив WinPE 8 Sergei Strelec.
Открываю акронис.
Удаляю все тома, какие есть.
Делаю диск mbr если он был gpt.
Форматирую под ntfs.
Делаю диск системным и активным.
Устанавливаю винду.
Пока проблем не было.

Will the circle be unbroken
By and by, Lord, by and by
There’s a better home awaiting
In the sky, Lord, in the sky