Я всегда бил в ДОСе Винды и ПрогФайлс и ставил 98-е из дистриба с неразбитых винтов. И всегда без проблем. Небольшие проблемы возникали при убиении Виндов и ПрогФайлс, что решимо. А ставить поверх старых смысла нет.